More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3060 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  63.8 
 
 		 582 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 714 aa  1434    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  62.5 
 
 		 546 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  65.16 
 
 		 694 aa  887    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  49.5 
 
 		 703 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  58.48 
 
 		 716 aa  786    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  52.76 
 
 		 711 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  62.84 
 
 		 717 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  51.37 
 
 		 709 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  59.22 
 
 		 687 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  71.1 
 
 		 708 aa  996    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  58.62 
 
 		 709 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  51.93 
 
 		 713 aa  682    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  73.26 
 
 		 734 aa  1001    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  60.61 
 
 		 703 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  61.2 
 
 		 703 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  56.43 
 
 		 685 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  64.66 
 
 		 714 aa  906    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  83.79 
 
 		 706 aa  1173    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  88.24 
 
 		 712 aa  1214    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  51.59 
 
 		 706 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  59.4 
 
 		 708 aa  759    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  53.49 
 
 		 713 aa  703    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  83.79 
 
 		 706 aa  1173    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  59.08 
 
 		 687 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  51.48 
 
 		 717 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  49.14 
 
 		 696 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  67.82 
 
 		 714 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  58.78 
 
 		 687 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  54.79 
 
 		 723 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  49.07 
 
 		 694 aa  611  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  57.54 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  53.79 
 
 		 577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  46.4 
 
 		 759 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  54.09 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  41.06 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  42.31 
 
 		 694 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  40.5 
 
 		 715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  38.52 
 
 		 636 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  41.91 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  34.89 
 
 		 615 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.8 
 
 		 658 aa  308  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  59.76 
 
 		 369 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.88 
 
 		 683 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.69 
 
 		 681 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.01 
 
 		 682 aa  299  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 654 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  34.28 
 
 		 688 aa  293  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  34.28 
 
 		 688 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  33.15 
 
 		 684 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.94 
 
 		 690 aa  292  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  34.21 
 
 		 684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  33.97 
 
 		 683 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  36.61 
 
 		 677 aa  280  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  34.53 
 
 		 687 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.18 
 
 		 667 aa  274  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  34.9 
 
 		 679 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  33.43 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  32.6 
 
 		 740 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  33.93 
 
 		 680 aa  257  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.78 
 
 		 679 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  31.67 
 
 		 709 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.63 
 
 		 689 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 645 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.01 
 
 		 751 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  33.62 
 
 		 687 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.43 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.56 
 
 		 727 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.38 
 
 		 754 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  31.33 
 
 		 669 aa  234  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.64 
 
 		 623 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  70.44 
 
 		 156 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.83 
 
 		 690 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  33 
 
 		 662 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.95 
 
 		 662 aa  210  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  72.58 
 
 		 133 aa  184  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.18 
 
 		 624 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.85 
 
 		 654 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.44 
 
 		 652 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.91 
 
 		 624 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  26.98 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  26.98 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  26.98 
 
 		 626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.76 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  28.25 
 
 		 654 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.61 
 
 		 624 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  64.24 
 
 		 172 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.47 
 
 		 729 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.88 
 
 		 652 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  69.11 
 
 		 129 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  69.92 
 
 		 129 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.7 
 
 		 670 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  36.51 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  43.91 
 
 		 597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  30.02 
 
 		 623 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.8 
 
 		 595 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  34.35 
 
 		 603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.76 
 
 		 660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  55.65 
 
 		 133 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  81.58 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>