104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7409 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  59.74 
 
 		 703 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  64.55 
 
 		 714 aa  704    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1105    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  64.25 
 
 		 582 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  65.34 
 
 		 706 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  65.34 
 
 		 706 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  67 
 
 		 712 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  63.58 
 
 		 714 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  62.68 
 
 		 714 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  62.78 
 
 		 717 aa  634  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  59.02 
 
 		 703 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  61.5 
 
 		 708 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  65.28 
 
 		 734 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  60.48 
 
 		 577 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  56.73 
 
 		 716 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  59.41 
 
 		 694 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  55.98 
 
 		 577 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  53.51 
 
 		 723 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  53.95 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  55.56 
 
 		 709 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  54.11 
 
 		 685 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  48.36 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  50.18 
 
 		 706 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  50.27 
 
 		 687 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  47.88 
 
 		 717 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  53.05 
 
 		 536 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  47.71 
 
 		 703 aa  495  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  51.36 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  50.64 
 
 		 687 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  49.35 
 
 		 713 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  48.11 
 
 		 713 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  46.52 
 
 		 696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  47.08 
 
 		 709 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  42.78 
 
 		 694 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  42.12 
 
 		 726 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  41.65 
 
 		 715 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  41.12 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  40.41 
 
 		 694 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  39.14 
 
 		 759 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  34.76 
 
 		 636 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  56.82 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  33.6 
 
 		 615 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  33.27 
 
 		 683 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.17 
 
 		 751 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  30.98 
 
 		 654 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  28.79 
 
 		 658 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  33.66 
 
 		 683 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  32.97 
 
 		 690 aa  208  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  33.27 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  34.04 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  33.79 
 
 		 677 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  32.17 
 
 		 688 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.76 
 
 		 687 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  32.17 
 
 		 688 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  33.59 
 
 		 682 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  32.81 
 
 		 681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  32.76 
 
 		 679 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  31.95 
 
 		 680 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 645 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  31.42 
 
 		 689 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.39 
 
 		 667 aa  173  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  30.6 
 
 		 740 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.08 
 
 		 687 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  28.22 
 
 		 709 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  31.17 
 
 		 765 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  31.01 
 
 		 692 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  30.76 
 
 		 679 aa  159  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.63 
 
 		 754 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  29.67 
 
 		 623 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.57 
 
 		 669 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  28.28 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  28.57 
 
 		 662 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  28.2 
 
 		 727 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.07 
 
 		 654 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.42 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  24.96 
 
 		 690 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.18 
 
 		 654 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.5 
 
 		 670 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  25.68 
 
 		 729 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.16 
 
 		 652 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  25.78 
 
 		 422 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  23.93 
 
 		 624 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  23.68 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  23.68 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  23.68 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  23.94 
 
 		 624 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  23.65 
 
 		 624 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  27.13 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  35.17 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  34.89 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  36.15 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  33.47 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  33.62 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  33.19 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  27.47 
 
 		 623 aa  73.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  33.54 
 
 		 595 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  38.14 
 
 		 624 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0235  hypothetical protein  47.44 
 
 		 106 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.946889 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.12 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  32.3 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>