More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2347 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  83.97 
 
 		 687 aa  267  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  82.05 
 
 		 687 aa  264  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  84.62 
 
 		 708 aa  263  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  80.77 
 
 		 687 aa  259  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  84.35 
 
 		 709 aa  255  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  77.36 
 
 		 714 aa  252  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  76.1 
 
 		 714 aa  243  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  74.21 
 
 		 734 aa  230  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  71.07 
 
 		 712 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  72.33 
 
 		 685 aa  227  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  70.44 
 
 		 714 aa  226  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  71.07 
 
 		 708 aa  226  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  70.44 
 
 		 706 aa  223  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  70.44 
 
 		 706 aa  223  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  70.51 
 
 		 703 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  70.06 
 
 		 711 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  69.23 
 
 		 703 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  69.62 
 
 		 706 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  69.62 
 
 		 713 aa  211  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  66.67 
 
 		 709 aa  206  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  63.29 
 
 		 717 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  60.62 
 
 		 694 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  64.56 
 
 		 713 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  62.75 
 
 		 703 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  59.62 
 
 		 696 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  62.66 
 
 		 694 aa  188  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  57.5 
 
 		 717 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  72.22 
 
 		 133 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  57.32 
 
 		 759 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  71.31 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  68.85 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  58.82 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.62 
 
 		 723 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  46.79 
 
 		 716 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  56.35 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  46.81 
 
 		 688 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  46.81 
 
 		 688 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  46.81 
 
 		 636 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  67.95 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  44.1 
 
 		 726 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  42.07 
 
 		 615 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  47.18 
 
 		 694 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  42.11 
 
 		 690 aa  94.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  45.39 
 
 		 681 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  44.06 
 
 		 667 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  46.48 
 
 		 679 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  45.39 
 
 		 683 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  43.97 
 
 		 682 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  44.03 
 
 		 658 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  44.68 
 
 		 690 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  44.68 
 
 		 683 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  43.51 
 
 		 684 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  43.51 
 
 		 684 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  44.68 
 
 		 680 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  45.39 
 
 		 687 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  44.68 
 
 		 687 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  46.04 
 
 		 679 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  40.14 
 
 		 715 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  39.16 
 
 		 662 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  39.06 
 
 		 595 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  44.68 
 
 		 692 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 645 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  44.68 
 
 		 689 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  37.5 
 
 		 626 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  37.5 
 
 		 626 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  37.5 
 
 		 626 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  37.5 
 
 		 624 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  37.76 
 
 		 662 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  38.89 
 
 		 624 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  38.89 
 
 		 624 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  36.81 
 
 		 624 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  40.68 
 
 		 485 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.71 
 
 		 754 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  37.5 
 
 		 765 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  39.06 
 
 		 669 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  39.04 
 
 		 709 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  44.22 
 
 		 677 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  45.28 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  34.72 
 
 		 576 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  38.06 
 
 		 727 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 654 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  34.97 
 
 		 785 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  36.24 
 
 		 740 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  35.56 
 
 		 729 aa  63.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  42.11 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  34.69 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  33.85 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  36.59 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  32.88 
 
 		 623 aa  60.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  37.17 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  51.22 
 
 		 597 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  33.56 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 660 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  34.15 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  30.47 
 
 		 654 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  30.66 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  36.3 
 
 		 660 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>