More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4159 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2733  nuclease  69.93 
 
 		 688 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  65.04 
 
 		 690 aa  833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  70.51 
 
 		 687 aa  879    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  72.39 
 
 		 692 aa  878    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  66.47 
 
 		 682 aa  860    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  68.96 
 
 		 687 aa  849    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  70.9 
 
 		 679 aa  862    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  59.44 
 
 		 677 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  70.68 
 
 		 689 aa  884    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  64.35 
 
 		 684 aa  805    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  100 
 
 		 679 aa  1351    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  66.52 
 
 		 683 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  71.53 
 
 		 680 aa  894    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  69.93 
 
 		 688 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  65.31 
 
 		 681 aa  835    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  70.88 
 
 		 683 aa  912    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  63.68 
 
 		 684 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  69.78 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  38.61 
 
 		 667 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  38.4 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  39.91 
 
 		 636 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  37.59 
 
 		 703 aa  340  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  40.44 
 
 		 765 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  38.56 
 
 		 709 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.51 
 
 		 754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  37.5 
 
 		 740 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  36.58 
 
 		 685 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  36.55 
 
 		 715 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  37.18 
 
 		 623 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  36.8 
 
 		 709 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  38.04 
 
 		 727 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  37.2 
 
 		 694 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  34.1 
 
 		 706 aa  303  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  34.1 
 
 		 706 aa  303  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  34.33 
 
 		 714 aa  299  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  34.3 
 
 		 713 aa  298  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.85 
 
 		 615 aa  298  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  35.88 
 
 		 694 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  35.86 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  34.67 
 
 		 751 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  34.52 
 
 		 708 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  34.99 
 
 		 703 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  35.03 
 
 		 687 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  35.08 
 
 		 714 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  33.8 
 
 		 687 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  33.62 
 
 		 687 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 706 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  34.43 
 
 		 726 aa  290  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  34.83 
 
 		 708 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  34.07 
 
 		 717 aa  287  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  35.15 
 
 		 709 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  35.85 
 
 		 694 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  34.46 
 
 		 711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  35.89 
 
 		 712 aa  283  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  33.68 
 
 		 703 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  35.33 
 
 		 713 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  33.24 
 
 		 759 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 645 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  35.8 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.54 
 
 		 654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  34.25 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  33.72 
 
 		 717 aa  263  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  33.14 
 
 		 716 aa  254  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  31.64 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  32.49 
 
 		 723 aa  243  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  31.17 
 
 		 654 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  30.78 
 
 		 652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  30.96 
 
 		 652 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  31.21 
 
 		 654 aa  213  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  43.63 
 
 		 380 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.76 
 
 		 662 aa  210  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  32.01 
 
 		 670 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.1 
 
 		 662 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  33.09 
 
 		 577 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  33.7 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  29.19 
 
 		 690 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  31.65 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  31.77 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  31.68 
 
 		 546 aa  174  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  30.6 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.87 
 
 		 624 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  28.71 
 
 		 624 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  37.41 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.44 
 
 		 729 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  36.81 
 
 		 624 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  37.06 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  37.06 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  37.06 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.3 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 660 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  35.66 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  28.79 
 
 		 660 aa  124  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  36.2 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  36.2 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  36.2 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  26.4 
 
 		 422 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  36.2 
 
 		 603 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  37.37 
 
 		 389 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  28.08 
 
 		 623 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  31.84 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>