More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0774 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
307 aa  613  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  53.98 
 
 
290 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  55.2 
 
 
284 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 
290 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
290 aa  195  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
292 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 
290 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  41.18 
 
 
295 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  38.85 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 
298 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
298 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  37.28 
 
 
274 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
274 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  38.25 
 
 
275 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
282 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.28 
 
 
274 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
284 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
307 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
300 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 
311 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.39 
 
 
311 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
286 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
292 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
299 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
335 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
292 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  33.07 
 
 
607 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.52 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.01 
 
 
285 aa  127  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  38.06 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
308 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  32.8 
 
 
626 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
306 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  30.04 
 
 
300 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  35.34 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  29.67 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 
283 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
295 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
330 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  31.99 
 
 
299 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
306 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
302 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
309 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
302 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
298 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
298 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
298 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
298 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  32.52 
 
 
421 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  32.52 
 
 
448 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
289 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  32.13 
 
 
325 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
289 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  32.13 
 
 
378 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  32.53 
 
 
301 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  30.74 
 
 
304 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  32.13 
 
 
448 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  32.13 
 
 
448 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
448 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
304 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  33.46 
 
 
297 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
293 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  27.55 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
278 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.9 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  28.46 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  32.45 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  34.96 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  28.08 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  28.08 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  34.96 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  34.96 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  37.37 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>