124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0740 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  100 
 
 		 505 aa  1034    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  53.69 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  55.62 
 
 		 501 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  53.6 
 
 		 506 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  57.17 
 
 		 511 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  52.6 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  51.2 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.8 
 
 		 504 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  54.42 
 
 		 503 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  52.24 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  51.41 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  52.11 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 496 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.4 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  52.44 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  48.2 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  46.87 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 496 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  50.1 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  46.65 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  47.77 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  47.47 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  47.77 
 
 		 740 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  50.6 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  45.6 
 
 		 500 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  47.46 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  46.46 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  48.29 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  47.85 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  46.46 
 
 		 503 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  47.26 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  46.46 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  51.11 
 
 		 497 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  50.62 
 
 		 518 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  46.23 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  52.62 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  48.57 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  45.88 
 
 		 492 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  48.39 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  47.17 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  46.96 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  46.28 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  47.99 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  45.04 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.82 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.89 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  46.03 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  45.82 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.23 
 
 		 515 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  43.47 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  40.61 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.25 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  40.4 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  36.23 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.52 
 
 		 538 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.45 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.12 
 
 		 538 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 538 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.56 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.56 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 537 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.71 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.26 
 
 		 502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.17 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 499 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.47 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.21 
 
 		 501 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.01 
 
 		 501 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 508 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 513 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 513 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.52 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 507 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 513 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  34.47 
 
 		 515 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  29.55 
 
 		 524 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.5 
 
 		 514 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 511 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  29.62 
 
 		 522 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  30.66 
 
 		 524 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.55 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>