169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0656 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  100 
 
 		 355 aa  705    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  49.55 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  50.66 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  30.5 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 279 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  31 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 		 276 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.92 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.63 
 
 		 286 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.49 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.49 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.45 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  28.67 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.06 
 
 		 289 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 297 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  31.03 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.53 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.28 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  26.94 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  32.06 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  29.29 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  31.41 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  30.59 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  25.98 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  25.98 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.45 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.45 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  28.95 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.61 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.7 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.13 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.74 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  26.52 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.82 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.57 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  23.74 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.47 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.62 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  25.62 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.73 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.15 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  25.33 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  25.33 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  30.19 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.68 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.66 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.97 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  21.39 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.61 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  23.11 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  26.3 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.32 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  22.58 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  21.12 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  24.29 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.44 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  23.97 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  24.16 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.17 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  23.88 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.7 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  22.89 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>