69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0072 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0072  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0701  putative circadian clock protein, KaiC  61.11 
 
 		 303 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0532  putative circadian clock protein, KaiC  56.16 
 
 		 301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1463  putative circadian clock protein, KaiC  54.87 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  53.03 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  51.71 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  48.29 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  27.46 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  23.95 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  27.2 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  25.95 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.5 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.63 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.77 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  28.5 
 
 		 575 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.5 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  25.87 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  23.51 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  23.74 
 
 		 559 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  28.5 
 
 		 567 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.54 
 
 		 488 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  25.67 
 
 		 512 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  22.57 
 
 		 498 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  27.18 
 
 		 562 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  22.57 
 
 		 509 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  22.57 
 
 		 509 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  22.57 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  26.47 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 		 574 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 570 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.6 
 
 		 519 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.4 
 
 		 574 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  25.77 
 
 		 500 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  27.62 
 
 		 528 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  25.93 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  24.59 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.5 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  23.78 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 		 563 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  24.06 
 
 		 512 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  24.02 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  22.48 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  26.03 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  23.86 
 
 		 560 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.3 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  24.79 
 
 		 481 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  26.46 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.22 
 
 		 569 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  24.79 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  27.75 
 
 		 584 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.59 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.5 
 
 		 521 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.5 
 
 		 521 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  25.21 
 
 		 478 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.37 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  24.9 
 
 		 477 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.18 
 
 		 573 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  22.31 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  22.6 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  23.56 
 
 		 684 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  22.99 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  23.08 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  24.69 
 
 		 482 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>