101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1515 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  54.49 
 
 
306 aa  349  4e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  42.86 
 
 
301 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 
296 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  24.32 
 
 
307 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.25 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.64 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  21.77 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.12 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  20.9 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  21.27 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  22.59 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  22.59 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  29.41 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  20.8 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.35 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.3 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  23.37 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.81 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.71 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  24.15 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.9 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  22.66 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  23.13 
 
 
401 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  21.61 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.28 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.92 
 
 
402 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  27.51 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  24.59 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.28 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  24.32 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.69 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.51 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  22.93 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.04 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.26 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  25.1 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  20.14 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  25.3 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0495  ribonuclease BN-like family protein  26.14 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.582599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  24.55 
 
 
365 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  23.46 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  20.27 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.6 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  22.05 
 
 
290 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  21.37 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.55 
 
 
374 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  21.56 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  23.93 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  23.75 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  20.22 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  23.56 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  23.14 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  23.14 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  23.14 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.15 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  25 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  21.59 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.64 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  22.01 
 
 
484 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  23.81 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  22.27 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  22.27 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  24.36 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  23.74 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  22.82 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  22.63 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  21.19 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  22.35 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  23.44 
 
 
469 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  20.92 
 
 
367 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  21.83 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  22.63 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  22.15 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  23.45 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  23.4 
 
 
433 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  21.51 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  23.89 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  22.96 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  22.96 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  20.64 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  23.23 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.13 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.13 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  23.84 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.94 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.19 
 
 
405 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  21.75 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  22.06 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  22.18 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  22.45 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  28.49 
 
 
487 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  25 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>