69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4537 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  100 
 
 		 493 aa  1009    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  91.37 
 
 		 581 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  97.5 
 
 		 552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  56.7 
 
 		 583 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  50.76 
 
 		 570 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  53.22 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  51.79 
 
 		 660 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.05 
 
 		 504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  52.25 
 
 		 673 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  40.96 
 
 		 554 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.83 
 
 		 697 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50.33 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  40.85 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  47.17 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  41.18 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  41.18 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  41.63 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  42 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  49.04 
 
 		 817 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  50.33 
 
 		 557 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  48.1 
 
 		 646 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  48.1 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.12 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  47.47 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  44.3 
 
 		 340 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  49.68 
 
 		 561 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  42.41 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.34 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  48.1 
 
 		 588 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  39.02 
 
 		 205 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  37.5 
 
 		 505 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  41.28 
 
 		 299 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  42.31 
 
 		 689 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.51 
 
 		 714 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  41.18 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  36.42 
 
 		 359 aa  120  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  52.6 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  53.95 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  37.66 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.18 
 
 		 251 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  35.71 
 
 		 691 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  58.33 
 
 		 1007 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  32.87 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  28.96 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.67 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  39.64 
 
 		 701 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  68.75 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  68.75 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  64 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  28.24 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  53.95 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  85.29 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  60.47 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  39.19 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  39.19 
 
 		 892 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  65.79 
 
 		 280 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  45.16 
 
 		 1137 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  61.9 
 
 		 1120 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  65.79 
 
 		 791 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  64.29 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  55.32 
 
 		 790 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  55.32 
 
 		 805 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  60.98 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  32.2 
 
 		 962 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  67.65 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  58.97 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  28 
 
 		 590 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  58.97 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>