96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1892 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  702    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  39.3 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  32.18 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  29.6 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  29.86 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  32.41 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  28.22 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.58 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.33 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  20.62 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  26.86 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  25.23 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  24.38 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  24.38 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  22.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  28.35 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  30.46 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  30.19 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.78 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  26.77 
 
 		 462 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  23.01 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 421 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 451 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 399 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  21.03 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 531 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  32.04 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.64 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  28.4 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  26.53 
 
 		 407 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.21 
 
 		 407 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.62 
 
 		 475 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 426 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>