More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2537 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2537  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 410 aa  818    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  41.15 
 
 		 403 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.59 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  42.33 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0823  cystathionine gamma-synthase  48.44 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  hitchhiker  0.000000196482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4472  cystathionine gamma-synthase  48.9 
 
 		 409 aa  312  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00089056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.46 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45.26 
 
 		 401 aa  297  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.67 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  42.61 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  42.61 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  42.61 
 
 		 397 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.61 
 
 		 397 aa  289  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  42 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  39.56 
 
 		 392 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  42.48 
 
 		 399 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  41.6 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  39.26 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.5 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  39.26 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  39.31 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  39.31 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  40.69 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.11 
 
 		 383 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  38.26 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.75 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.39 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  42.39 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  41.09 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.75 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.14 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  40.79 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  40.94 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  40.35 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.8 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.28 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.16 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  40.59 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2878  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.5 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 		 413 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  43.95 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.79 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  40.35 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.45 
 
 		 398 aa  272  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  41.38 
 
 		 378 aa  272  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  38.2 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.6 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.4 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  39.05 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  40.64 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  37.56 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  39.75 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  36.88 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  37.31 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  39.3 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  35.66 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  40.5 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 391 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  37.87 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.89 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  41.27 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  36.76 
 
 		 394 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  39.04 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  41.02 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.39 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  39.04 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.35 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  40.76 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.05 
 
 		 392 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0066  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.46 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  38.77 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40 
 
 		 402 aa  262  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  39.04 
 
 		 377 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>