More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2475 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
420 aa  834    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.62 
 
 
404 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.81 
 
 
397 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2318  peptidase M20  40.69 
 
 
449 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00838569  decreased coverage  0.00000161577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.1 
 
 
423 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.68 
 
 
395 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.07 
 
 
423 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.07 
 
 
439 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  33.33 
 
 
373 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
433 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.3 
 
 
413 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  33.06 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  34.81 
 
 
368 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  30.2 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  33.25 
 
 
380 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.44 
 
 
381 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 
435 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  27.91 
 
 
422 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 
402 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.86 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 
422 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 
433 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.98 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  32.12 
 
 
389 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.2 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  26.69 
 
 
422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
400 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  25.53 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  29.2 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.21 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  25.17 
 
 
424 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 
424 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.63 
 
 
395 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
422 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
422 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
422 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.97 
 
 
447 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.09 
 
 
417 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  24.77 
 
 
424 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
429 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  24.3 
 
 
424 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  28.5 
 
 
409 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  24.07 
 
 
426 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  31.47 
 
 
386 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  24.07 
 
 
426 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  27.45 
 
 
432 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
422 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  24.71 
 
 
424 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
422 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 
419 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  25.22 
 
 
422 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.79 
 
 
395 aa  123  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.79 
 
 
395 aa  123  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  30.53 
 
 
394 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  29.26 
 
 
753 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.41 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  23.83 
 
 
424 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.69 
 
 
388 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  30.65 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.39 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.23 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  28.22 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.81 
 
 
394 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.72 
 
 
409 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 
364 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.43 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.48 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.72 
 
 
376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.92 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.84 
 
 
395 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  34.26 
 
 
437 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.3 
 
 
388 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.99 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 
405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  26.72 
 
 
395 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.75 
 
 
423 aa  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.24 
 
 
385 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.53 
 
 
387 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>