154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2347 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  47.26 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  44.16 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  41.75 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  41.62 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 		 197 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  40.61 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  41.12 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  41.62 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  41.41 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  41.62 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  42.5 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  33.99 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  37.82 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  38.42 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  35.42 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  32.85 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  34.38 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.02 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  35.6 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.64 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  37.06 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.79 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  32.8 
 
 		 216 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.16 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  32.98 
 
 		 723 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  28.64 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>