More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4046 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3321  cation/multidrug efflux pump, membrane-fusion protein  99.22 
 
 		 387 aa  754    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 387 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1780  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.51 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  45.51 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.25 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  40 
 
 		 448 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  40.78 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  42.7 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  42.74 
 
 		 428 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  42.27 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  40.17 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  42.11 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  41.28 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  40.76 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.8 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  43.88 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  42.2 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  40.27 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  41.19 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  39.2 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  42.97 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.67 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  41.53 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  40.52 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  39.07 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.4 
 
 		 433 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  42.98 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  41.5 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.45 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.45 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.21 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  41.89 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  41.21 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  44.54 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  40.75 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  42.23 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  41.53 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  42.39 
 
 		 480 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  41.29 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  39.71 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  43.7 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  38.78 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  42.23 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.16 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  41.45 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  40.59 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  39.89 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  43.73 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  42.69 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  45.14 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.5 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2512  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.42 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.44 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  39.89 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  41.02 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  37.7 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.39 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.24 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  40.05 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  43.77 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  37.98 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.69 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.99 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  38.96 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.9 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.48 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  41.01 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.43 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1335  RND family efflux transporter MFP subunit  44 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  42.09 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  38.96 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  37.7 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  37.7 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  38.69 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.69 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.49 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  38.69 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  38.69 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  38.69 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>