More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3206 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3206  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 554 aa  1118    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.85 
 
 		 1469 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  35.35 
 
 		 1715 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 		 1473 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  29.15 
 
 		 1707 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  29.43 
 
 		 717 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.75 
 
 		 709 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.35 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.18 
 
 		 704 aa  84  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4178  putative transposase, ISRm14  81.25 
 
 		 102 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 701 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.62 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  83.33 
 
 		 102 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 1062 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.96 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 731 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.4 
 
 		 665 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  81.25 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  81.25 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  79.17 
 
 		 136 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 732 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  24.05 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.05 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1067 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 688 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 1001 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.61 
 
 		 849 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.91 
 
 		 838 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.04 
 
 		 710 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  33.9 
 
 		 682 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  26.87 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 1032 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.15 
 
 		 739 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  25.98 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  27.61 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.19 
 
 		 673 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.17 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.65 
 
 		 754 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  30.15 
 
 		 736 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.92 
 
 		 806 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 726 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.35 
 
 		 1023 aa  70.1  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 690 aa  70.1  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.02 
 
 		 755 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  23.58 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.75 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 845 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.85 
 
 		 699 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.61 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.79 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.07 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.85 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 714 aa  67.4  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.05 
 
 		 715 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  28.04 
 
 		 765 aa  67  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 670 aa  67  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.45 
 
 		 689 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.79 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  26.97 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.46 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.79 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 1019 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 787 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.46 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.2 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.24 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.24 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  29.41 
 
 		 900 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 794 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 768 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.78 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.24 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 932 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  48.39 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>