More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3157 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.66 
 
 		 447 aa  832    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 447 aa  846    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.55 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  45.92 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  41.02 
 
 		 471 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  37.44 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  36.99 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  36.6 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  34.84 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  33.64 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  33.58 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.54 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  32.49 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  29.24 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  34.66 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  31.22 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  34.81 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  31 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  32.96 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  34.47 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  32.74 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  32.24 
 
 		 458 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  30.95 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  29.13 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  35 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  30.33 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  31.94 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  39.09 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.92 
 
 		 442 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  32.67 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  29.46 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.04 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  28.6 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  28.22 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.08 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  29.78 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  28.28 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>