More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2414 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  83.72 
 
 		 302 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  82.33 
 
 		 250 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  57.97 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  54.76 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  50.84 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  53.47 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  52.54 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  50 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  47.81 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  46.39 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  47.77 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.74 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  43.33 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  44.15 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.26 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  45.3 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.47 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.33 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  40.46 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.46 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  40.46 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.46 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.29 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  40.13 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.13 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  38.46 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.74 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  40.13 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  40.33 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.13 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.64 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.64 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  40.33 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  40 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.8 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  41.06 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.51 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.62 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  43 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  52.06 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.7 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  34.68 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  34.68 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.86 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.33 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  37.25 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  41.95 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.07 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.63 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  42.37 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  35.69 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  31.76 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.78 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  37.29 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  34.59 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  32.69 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.62 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.84 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.84 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.97 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  33.71 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.72 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  33.6 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.34 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.09 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.21 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  34.28 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  38.58 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.58 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  39.74 
 
 		 153 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.83 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.71 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.71 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  33.33 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  33.89 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  38.07 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  33.73 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>