205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2312 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  89.01 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  89.01 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  64.02 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  50.53 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  49.47 
 
 		 194 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  48.69 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  47.89 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  48.21 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  44.69 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  39.36 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  37.06 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  39.36 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  39.36 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  38.83 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  39.89 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  39.15 
 
 		 194 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  39.15 
 
 		 194 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  36.46 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  37.23 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.72 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  35.79 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  33.16 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  33.51 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  35.38 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  33.51 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  33.51 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  34.83 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  32.99 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  33.85 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  37.43 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.87 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  36.46 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  35.2 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  35.2 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  33.16 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  33.85 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  32.45 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  32.61 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  32.99 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  34.1 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  34.1 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  30.05 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  32.95 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  30.26 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  30.29 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 677 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  23.3 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>