More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1838 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  53.93 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  52.43 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  51.44 
 
 		 302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 		 287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  49.82 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  48.58 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  49.16 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 298 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  42.03 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  49.29 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  46.29 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  48.93 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  42.03 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  49.63 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  49.82 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  45.86 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  49.12 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  48.76 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  46.15 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  47.16 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  43.71 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  48.57 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 		 448 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 		 448 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  48.06 
 
 		 448 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  48.2 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  47.7 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 		 607 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 626 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  32.86 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.42 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  40.29 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  37.55 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  40.39 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  40.32 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  36.29 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  36.82 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.06 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.82 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.37 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  34.68 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>