More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1594 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  47.01 
 
 		 794 aa  674    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  100 
 
 		 785 aa  1585    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.5 
 
 		 804 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.48 
 
 		 785 aa  614  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  42.23 
 
 		 795 aa  599  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  39.68 
 
 		 785 aa  592  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  37.72 
 
 		 905 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  37.94 
 
 		 841 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  37.47 
 
 		 843 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  40.06 
 
 		 910 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  36.79 
 
 		 887 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  36.67 
 
 		 852 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  38.14 
 
 		 834 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  37.42 
 
 		 843 aa  515  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.61 
 
 		 841 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  37.94 
 
 		 834 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  36.76 
 
 		 844 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  36.68 
 
 		 777 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  36.31 
 
 		 845 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.72 
 
 		 855 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.62 
 
 		 821 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  35.74 
 
 		 778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  36.52 
 
 		 767 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.36 
 
 		 854 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  36.62 
 
 		 840 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.78 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.01 
 
 		 864 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.01 
 
 		 854 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  37.3 
 
 		 788 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.21 
 
 		 856 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.47 
 
 		 779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  36.32 
 
 		 792 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.99 
 
 		 857 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.72 
 
 		 780 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.91 
 
 		 782 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  36.06 
 
 		 782 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.7 
 
 		 844 aa  445  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  34.7 
 
 		 785 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  34.67 
 
 		 781 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  35.42 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.67 
 
 		 803 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  35.01 
 
 		 772 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  35.15 
 
 		 799 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  36.34 
 
 		 796 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  33.12 
 
 		 798 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.57 
 
 		 769 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  34.59 
 
 		 748 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.52 
 
 		 769 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  30.46 
 
 		 773 aa  371  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.04 
 
 		 770 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.45 
 
 		 770 aa  361  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  31.65 
 
 		 767 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.8 
 
 		 784 aa  354  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  30.62 
 
 		 791 aa  354  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.72 
 
 		 769 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  32.13 
 
 		 770 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.72 
 
 		 768 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.72 
 
 		 768 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.72 
 
 		 768 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  32.28 
 
 		 752 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.76 
 
 		 769 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.07 
 
 		 769 aa  351  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  31.72 
 
 		 765 aa  350  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.59 
 
 		 768 aa  349  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  30.68 
 
 		 769 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  30.68 
 
 		 769 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  30.97 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  30.68 
 
 		 769 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.68 
 
 		 769 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  30.45 
 
 		 768 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.45 
 
 		 769 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.45 
 
 		 769 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 768 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.64 
 
 		 768 aa  347  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  31.38 
 
 		 790 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  30.81 
 
 		 778 aa  344  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.27 
 
 		 752 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.96 
 
 		 808 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.53 
 
 		 769 aa  337  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  30.86 
 
 		 765 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.38 
 
 		 750 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.25 
 
 		 765 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.06 
 
 		 802 aa  333  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  30.37 
 
 		 790 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  29.47 
 
 		 744 aa  331  3e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.52 
 
 		 765 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  31.39 
 
 		 760 aa  328  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.76 
 
 		 758 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  30.31 
 
 		 913 aa  324  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 		 787 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.63 
 
 		 763 aa  318  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  31.03 
 
 		 772 aa  317  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.55 
 
 		 784 aa  317  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.49 
 
 		 766 aa  312  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  29.22 
 
 		 806 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  29.47 
 
 		 788 aa  310  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  30.35 
 
 		 763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.62 
 
 		 793 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.49 
 
 		 793 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  30.79 
 
 		 780 aa  307  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>