More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1306 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  68.01 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.81 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  67.04 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  66.3 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  65.93 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  64.21 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.73 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.65 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 		 289 aa  331  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.89 
 
 		 284 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.25 
 
 		 284 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.25 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  61.96 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.95 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  60.52 
 
 		 293 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  59.78 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 278 aa  324  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 		 293 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  60.15 
 
 		 271 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  58.67 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.76 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  55.97 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  55.6 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  61.99 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  59.41 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.92 
 
 		 280 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  59.04 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  59.04 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  58.46 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  56.99 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  57.35 
 
 		 284 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 274 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.56 
 
 		 290 aa  285  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  53.24 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  54.21 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.22 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 240 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  32.83 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.87 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 268 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 254 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.55 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>