More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0192 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0192  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 475 aa  912    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.684576  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.23 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  32.05 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.49 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  31.22 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  31.22 
 
 		 457 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  32.05 
 
 		 457 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  32.05 
 
 		 457 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  31.22 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  31.22 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  31.83 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.74 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  31.83 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  29.55 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30.41 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.41 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.41 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  29.63 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.36 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.36 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 461 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29.49 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.72 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  30.27 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  28.1 
 
 		 472 aa  170  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  31.76 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  28.98 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  30.87 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  28.44 
 
 		 456 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.34 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.76 
 
 		 425 aa  152  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25.67 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  25.67 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  25.67 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25.67 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.95 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.89 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  25.89 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  25.89 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  31.19 
 
 		 462 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  28.09 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  25.71 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  27.88 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  30.25 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  27.23 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  29.53 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1311  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  29.83 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  30.56 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  30.56 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2139  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.76 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.91 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  28.57 
 
 		 441 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  30.02 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  31.17 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2365  MATE efflux family protein  32.83 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.469261  normal  0.875331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  26.33 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>