More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0910 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.66 
 
 		 393 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  773    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  53.42 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.24 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  51.85 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  55.37 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  55.08 
 
 		 400 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  55.08 
 
 		 400 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.9 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  55.11 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  55.11 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.83 
 
 		 399 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  53.07 
 
 		 395 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  53.01 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  53.07 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.55 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.55 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.55 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  48.64 
 
 		 389 aa  318  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  54.72 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  48.48 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.19 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  48.92 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  50.79 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  52.51 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 469 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.03 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  47.31 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  43.2 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  41.45 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  43.77 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  45.48 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.29 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  43.9 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  46.26 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  45.08 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  43.31 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  46.54 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  47.03 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  43.35 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  44.56 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  44.3 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.38 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  44.3 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  43.2 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  43.2 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 422 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  46.41 
 
 		 408 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  44.01 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  45.23 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.83 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  44.94 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  47.43 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  46.24 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  44.92 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.86 
 
 		 415 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.22 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  44.63 
 
 		 432 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  41.41 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  44.38 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.36 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  45.96 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  43.82 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.41 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  45.81 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.73 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  45.91 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  47.84 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  42.41 
 
 		 447 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.26 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  44.28 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.79 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  42.9 
 
 		 420 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  42.08 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.79 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.79 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  43.56 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  46.6 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  46.04 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  42.9 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  42.9 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  42.9 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  42.9 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  42.9 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  42.62 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  42.63 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.35 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  42.35 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  47.03 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  42.35 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  42.35 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  42.35 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>