91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1898 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 247 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  45.61 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  38.06 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  40.09 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  36.25 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  37.08 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  36.21 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  36.21 
 
 		 270 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  34.45 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  34.45 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  36.89 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  29.91 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  29.78 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.22 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  45.53 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.55 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  28.76 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  25.73 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  30.26 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  28.38 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  27.5 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.97 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  26.48 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  24.69 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  29.39 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.83 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  23.43 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.83 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.71 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  27.2 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  24.43 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.38 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  26.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  23.42 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  23.42 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  23.42 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  24.27 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.01 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  24.15 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  26.09 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  25.21 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  23.75 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  21.3 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  24.38 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  22.78 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  23.51 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  24.22 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  24.79 
 
 		 344 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  21.49 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.18 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  25.63 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  22.27 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  25.2 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  21.86 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25.4 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  25.55 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  18 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  27.51 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  23.24 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  24.02 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  21.27 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  24.37 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  23.39 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25.86 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  25.79 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.81 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  26.72 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 		 247 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  29.2 
 
 		 247 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>