190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1909 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  56.54 
 
 
540 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.67 
 
 
535 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.54 
 
 
535 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.36 
 
 
532 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
568 aa  1167    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  55.52 
 
 
533 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  64.05 
 
 
544 aa  716    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  57.64 
 
 
535 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.92 
 
 
563 aa  964    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  54.66 
 
 
525 aa  633  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.68 
 
 
508 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.02 
 
 
508 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.68 
 
 
508 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.51 
 
 
508 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.82 
 
 
508 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.99 
 
 
508 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.79 
 
 
507 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.71 
 
 
508 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.54 
 
 
526 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.52 
 
 
546 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.3 
 
 
530 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.95 
 
 
540 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.62 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.5 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.39 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.87 
 
 
534 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.87 
 
 
534 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.97 
 
 
541 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.02 
 
 
531 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.11 
 
 
532 aa  299  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.89 
 
 
530 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.38 
 
 
531 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.33 
 
 
528 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.58 
 
 
531 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.6 
 
 
517 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.89 
 
 
523 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.33 
 
 
525 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.06 
 
 
525 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.54 
 
 
523 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.88 
 
 
525 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.68 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.85 
 
 
526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.54 
 
 
541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.8 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.28 
 
 
524 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.5 
 
 
508 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.54 
 
 
480 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  22.4 
 
 
402 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.15 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  28.26 
 
 
493 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  26.67 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  27.36 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  25.24 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  27.33 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  25.3 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  37.88 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  32.42 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  33.14 
 
 
509 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  37.88 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.06 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  29.03 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  27.13 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  31.46 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  24.7 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  28.02 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  30.05 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  30.56 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2854  chlorophyllide reductase subunit Z  29.95 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  25.56 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  30.23 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  25.12 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.19 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  36.03 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  23.91 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  35.78 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.51 
 
 
446 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  22.75 
 
 
459 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  23.37 
 
 
509 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  23.04 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.77 
 
 
463 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2959  chlorophyllide reductase subunit Z  35.29 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.123576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.77 
 
 
461 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.63 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  18.81 
 
 
425 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  22.74 
 
 
452 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  22.14 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.97 
 
 
448 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  27.92 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.66 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  31.09 
 
 
451 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  25.5 
 
 
511 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  23.72 
 
 
462 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  29.65 
 
 
480 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  25.08 
 
 
469 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.49 
 
 
533 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  21.64 
 
 
460 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.93 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  21.75 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.9 
 
 
485 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  23.64 
 
 
511 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>