More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1738 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  100 
 
 		 465 aa  943    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  86.88 
 
 		 465 aa  831    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  64.51 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  59.83 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  51.77 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  49.67 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.32 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  49.12 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  44.1 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  46.01 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  43.49 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  43.58 
 
 		 447 aa  353  5e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  44.93 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  42.57 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 446 aa  346  6e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  41.31 
 
 		 427 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  44.16 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  37.37 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  41.48 
 
 		 471 aa  329  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  45.98 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  37.42 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  37.42 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.42 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  37.42 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  37.42 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  41.44 
 
 		 445 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  41.08 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.72 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  43.76 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  36.72 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.72 
 
 		 454 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  42.66 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  40.67 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  35.57 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  42.79 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  40.63 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  43.22 
 
 		 418 aa  309  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  41.82 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  40.58 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  40.14 
 
 		 419 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  39.27 
 
 		 426 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  39.04 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  39.12 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  38.75 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  38.95 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  41.82 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  43.4 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  38.95 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  41.06 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  36.22 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  38.95 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.82 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  37.33 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  38.72 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  38.13 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  39.44 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  38.72 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  37.98 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 		 426 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.84 
 
 		 434 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  39.68 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  37.67 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  36.04 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.02 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  38.15 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  40.56 
 
 		 447 aa  282  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  40.04 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  38.41 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.25 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  39.24 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.25 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  40.36 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  37.67 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  37.61 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.02 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 		 440 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  39.57 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  38.79 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  42.89 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  38.9 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  37.19 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  39.02 
 
 		 425 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  39.01 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  35.07 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  38.43 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  35.14 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  38.43 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  35.74 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>