62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0074 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  62.03 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  46.15 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  35.58 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  36.13 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  34.71 
 
 		 271 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  38.39 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.88 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.97 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  36.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  34.75 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.34 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  32.8 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  33.05 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  36.07 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  31.93 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  27.87 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.1 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  28.3 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  29.86 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  30.09 
 
 		 276 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  27.56 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  32.52 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  33.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.09 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  24.59 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.15 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 		 123 aa  49.3  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 131 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  35.23 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  27.52 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  24.06 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  26.19 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  30.71 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  30 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  34.19 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  31.63 
 
 		 252 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.89 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  27.13 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  23.48 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  32.53 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  20.83 
 
 		 151 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 99 aa  40.8  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  28.18 
 
 		 115 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>