234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4520 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  100 
 
 		 274 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  52.17 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40.99 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.64 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  37.32 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34.47 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  35.96 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.12 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.71 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.65 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.69 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  32.53 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  34.28 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  30.45 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  42.35 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.74 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  32.74 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  31.62 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  34.14 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.68 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  32.39 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  34.11 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  32.17 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.87 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.89 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  29.79 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.89 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  30.9 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  31.38 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  30.32 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.12 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.58 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  40.64 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  31.71 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  44.22 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  39.74 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  35.07 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  41.72 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  42.94 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.15 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.15 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.51 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.15 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.15 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  30.63 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  41.83 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  39.04 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.09 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.18 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  29.21 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  43.54 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.6 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  39.86 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.07 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  45.27 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.22 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.51 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  38.16 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  37.16 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  39.92 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.69 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  28.52 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  25 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  28.31 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>