152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4141 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 408 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  52.37 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  54.18 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  53.28 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  53.92 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  54.06 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  54.57 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  54.31 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  54.57 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  54.57 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  54.31 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  54.35 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  52.85 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  53.74 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  54.09 
 
 		 407 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  47.49 
 
 		 410 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  54.45 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 411 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  52.56 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  47.72 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  52.31 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  50.79 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  47.52 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  52.73 
 
 		 395 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  50.92 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  47.42 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  46.56 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  47.91 
 
 		 397 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  48.53 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  46.77 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  47.64 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  46.52 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  46.52 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  47.91 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  46.52 
 
 		 419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  47.21 
 
 		 416 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  46.52 
 
 		 405 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  46.52 
 
 		 405 aa  318  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  46.27 
 
 		 419 aa  318  7.999999999999999e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  52.14 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  48.51 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  46.95 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  49.5 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  46.65 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  46.11 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  47.62 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  46.95 
 
 		 405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  46.95 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  46.95 
 
 		 405 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  46.95 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  45.73 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  44.76 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  44.5 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  44.5 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  44.5 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  47.65 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  47.09 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  47.09 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  46.81 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  46.81 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  46.54 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  39.73 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  46.26 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  41.64 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  40.85 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  39.89 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  41.51 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  35.53 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 413 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 225 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  40 
 
 		 182 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.45 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.45 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  24.57 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.07 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>