65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2726 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 
475 aa  957    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  40.98 
 
 
468 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  40.17 
 
 
468 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  39.57 
 
 
364 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  44.44 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  48.86 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  41.41 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  46.15 
 
 
679 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  44.32 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  43.82 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  38.85 
 
 
896 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  39.32 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  40.82 
 
 
851 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40.54 
 
 
741 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  37.34 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  48.1 
 
 
287 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  43.37 
 
 
1061 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  40.45 
 
 
1162 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  41.03 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  37.61 
 
 
931 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  33.33 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  43.59 
 
 
1270 aa  60.1  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  42.67 
 
 
844 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38.38 
 
 
615 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  41.57 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  41.18 
 
 
908 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  39.53 
 
 
990 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  35.58 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  40 
 
 
489 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  38 
 
 
430 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  38.04 
 
 
695 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  38.33 
 
 
829 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4775  hypothetical protein  26.75 
 
 
446 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  50.77 
 
 
562 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  39.25 
 
 
578 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.08 
 
 
492 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 
388 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  28.18 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  39.74 
 
 
997 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  38.46 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.9 
 
 
2334 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  36.56 
 
 
797 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  40.79 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.79 
 
 
386 aa  50.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.63 
 
 
966 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  34.04 
 
 
668 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.65 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  31.52 
 
 
833 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  36.46 
 
 
595 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  32.7 
 
 
389 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  34 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  30.43 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  31.82 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  30.21 
 
 
902 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  33.98 
 
 
1302 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0552  autotransporter beta-domain-containing protein  27.55 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 
1092 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.29 
 
 
542 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  37.84 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  36.23 
 
 
2324 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  39.5 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.95 
 
 
608 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  32.95 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  27.38 
 
 
524 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>