84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5356 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  92.25 
 
 		 427 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  79.76 
 
 		 425 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  48.3 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  48.58 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  46.23 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  45.48 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  20.91 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.56 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.46 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1846  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.15 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000328949  hitchhiker  0.000299807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  20.78 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.08 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.93 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.85 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  19.78 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  19.48 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  31.54 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.9 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  29.76 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.9 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  29.17 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.9 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.42 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 901 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  20.58 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>