70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0711 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  912    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  92.18 
 
 		 435 aa  853    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  84.76 
 
 		 435 aa  775    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  84.99 
 
 		 435 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  45.48 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  45.48 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  45.24 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 422 aa  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.1 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1679  extracellular solute-binding protein  20.3 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000895921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.06 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  20.82 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.9 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.92 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.38 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.06 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  20.43 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.57 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.57 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.68 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.41 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.41 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.52 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 901 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>