154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0067 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 414 aa  856    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1679  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000895921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.38 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  20.46 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.41 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.67 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.62 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  21.4 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.08 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.51 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.06 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.09 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.33 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  19.37 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  18.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  18.47 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.98 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.72 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  19.09 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  19.38 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  21.22 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.03 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.03 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  20.67 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.54 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.91 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.02 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  22.51 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  20.7 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  20.7 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  21.97 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>