More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2659 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  100 
 
 
363 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  92.56 
 
 
363 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  70.75 
 
 
374 aa  534  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  56.55 
 
 
329 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  55.84 
 
 
331 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
440 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  52.6 
 
 
367 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  55.31 
 
 
329 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  53.71 
 
 
325 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  52.34 
 
 
358 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  53.74 
 
 
357 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  53.35 
 
 
372 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  53.43 
 
 
325 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
331 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  51.4 
 
 
333 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  54.29 
 
 
351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  52.23 
 
 
356 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
352 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  53.19 
 
 
352 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  54.57 
 
 
325 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.01 
 
 
373 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.03 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.44 
 
 
381 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
366 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
423 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.37 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 
363 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  41.36 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
382 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 
355 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.26 
 
 
399 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  44.09 
 
 
346 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  44.09 
 
 
346 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  40.17 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.89 
 
 
352 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 
366 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  44.03 
 
 
399 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.35 
 
 
327 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
327 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 
372 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5881  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  39.79 
 
 
369 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
327 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
327 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
331 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 
447 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
331 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
331 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 
370 aa  265  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.23 
 
 
383 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 
363 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 
354 aa  265  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.83 
 
 
369 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
327 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
381 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.4 
 
 
379 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
373 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 
367 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.11 
 
 
382 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  45.05 
 
 
369 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  42.77 
 
 
355 aa  262  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3271  ABC transporter related  42.36 
 
 
362 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800565  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
372 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
372 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
382 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  50.84 
 
 
356 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
369 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.61 
 
 
353 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
369 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.6 
 
 
380 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.16 
 
 
353 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.24 
 
 
374 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 
362 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.68 
 
 
373 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 
385 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
377 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.28 
 
 
368 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.04 
 
 
343 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.51 
 
 
364 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
372 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
353 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.23 
 
 
364 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 
361 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.25 
 
 
380 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  38.44 
 
 
374 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
374 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
381 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  43.4 
 
 
367 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
374 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.31 
 
 
367 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 
374 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
367 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 
365 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>