More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0628 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  100 
 
 
386 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  74.87 
 
 
386 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3534  amidohydrolase  68.36 
 
 
389 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  51.96 
 
 
394 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  51.96 
 
 
394 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  51.54 
 
 
391 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  51.16 
 
 
394 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  50.77 
 
 
394 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  50.77 
 
 
394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  51.04 
 
 
387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  47.11 
 
 
382 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.09 
 
 
387 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.83 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  49.73 
 
 
376 aa  352  8.999999999999999e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.33 
 
 
388 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 
390 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.47 
 
 
389 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  47.64 
 
 
389 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.23 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  47.64 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.88 
 
 
396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.45 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  45.22 
 
 
397 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  45.17 
 
 
398 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  47.12 
 
 
389 aa  334  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.68 
 
 
387 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  47 
 
 
390 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.03 
 
 
394 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.7 
 
 
397 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  45.43 
 
 
423 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  47.87 
 
 
389 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  47.37 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  48.04 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  47.12 
 
 
384 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  47.11 
 
 
388 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  47.12 
 
 
384 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  47.09 
 
 
387 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  46.72 
 
 
390 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.66 
 
 
395 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  46.48 
 
 
393 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  47.88 
 
 
388 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.98 
 
 
398 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  44.1 
 
 
397 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.42 
 
 
397 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  44.42 
 
 
396 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  46.35 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  46.07 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  45.97 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  46.03 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  44.85 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  47.68 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  47.3 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  46.44 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  47.26 
 
 
386 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  47.62 
 
 
381 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  45.01 
 
 
389 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.21 
 
 
393 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.04 
 
 
399 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.04 
 
 
399 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.83 
 
 
396 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  46.44 
 
 
382 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.77 
 
 
396 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  47.38 
 
 
388 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.67 
 
 
388 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  46.84 
 
 
390 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  44.59 
 
 
387 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.77 
 
 
396 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  45.01 
 
 
390 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  47.16 
 
 
389 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 
387 aa  315  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  44.33 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.03 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  46.15 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  45.01 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  47.55 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  45.72 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.49 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  45.43 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  45.43 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  45.43 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  47.77 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.19 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  48.3 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  44.82 
 
 
399 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.88 
 
 
396 aa  311  9e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  49.7 
 
 
338 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.4 
 
 
396 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  43.95 
 
 
387 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  44.59 
 
 
402 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  44.59 
 
 
387 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  44.19 
 
 
403 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  45.55 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  46.85 
 
 
396 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.12 
 
 
396 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.16 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  46.03 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  44.65 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1887  amidohydrolase  48.72 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.83 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>