More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3534 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009469  Acry_3534  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  788    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  67.11 
 
 
386 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  68.36 
 
 
386 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  48.7 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  49.74 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  48.7 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  50.26 
 
 
387 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 
391 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  49.48 
 
 
394 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  48.97 
 
 
394 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48 
 
 
388 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  43.64 
 
 
397 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  43.23 
 
 
397 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  48.32 
 
 
381 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.12 
 
 
398 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.4 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.4 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.4 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.09 
 
 
399 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  42.71 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.83 
 
 
396 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  45.48 
 
 
376 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  43.52 
 
 
397 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  43.77 
 
 
382 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  42.19 
 
 
397 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  43.64 
 
 
396 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  43.49 
 
 
396 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  43.49 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  42.45 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.68 
 
 
389 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  43.26 
 
 
397 aa  318  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  46.05 
 
 
390 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  44.71 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  43.58 
 
 
387 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  45.38 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.62 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  43.05 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.22 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  46.42 
 
 
389 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  46.13 
 
 
384 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  41.82 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  42.86 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  45.99 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.4 
 
 
388 aa  311  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  44.15 
 
 
390 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  46.15 
 
 
389 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1887  amidohydrolase  51.23 
 
 
389 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  48.02 
 
 
385 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  44.62 
 
 
386 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  43.16 
 
 
387 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.48 
 
 
393 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  46.24 
 
 
384 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  41.71 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  46.36 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  43.39 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  42.16 
 
 
395 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  41.43 
 
 
404 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  42.42 
 
 
395 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  45.87 
 
 
388 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.53 
 
 
392 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.86 
 
 
387 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  46.13 
 
 
384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  43.35 
 
 
389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  45.89 
 
 
382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  45.48 
 
 
387 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.86 
 
 
387 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.95 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  42.74 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.67 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  45.6 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  45.53 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  43.04 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  42.97 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  42.97 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  46.03 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45.14 
 
 
387 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.32 
 
 
379 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45.14 
 
 
387 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  45.5 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  42.97 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  46.56 
 
 
388 aa  305  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  42.71 
 
 
401 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  42.86 
 
 
388 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  43.01 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  47.75 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  43.83 
 
 
389 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.59 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  45.19 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  44.97 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  43.58 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  44.68 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  44.59 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  43.19 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  43.54 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  41.9 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  46.13 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  45.09 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  44.44 
 
 
395 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  43.68 
 
 
384 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  46.68 
 
 
389 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>