More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1887 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1887  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  775    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  54.99 
 
 
389 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  53.71 
 
 
388 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.47 
 
 
395 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.34 
 
 
396 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  51.65 
 
 
390 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.97 
 
 
396 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.46 
 
 
396 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.46 
 
 
396 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.67 
 
 
387 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  51.27 
 
 
389 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  51.96 
 
 
389 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.67 
 
 
387 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50.94 
 
 
388 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.21 
 
 
387 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  48.07 
 
 
408 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  51.14 
 
 
390 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.81 
 
 
387 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.81 
 
 
387 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  50.26 
 
 
424 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  46.33 
 
 
397 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  45.69 
 
 
397 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  52.58 
 
 
385 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.57 
 
 
412 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  51.39 
 
 
390 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
389 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.43 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.61 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.78 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.43 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  50.13 
 
 
387 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
387 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  51.43 
 
 
396 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.43 
 
 
396 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  51.41 
 
 
395 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  52.88 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 
387 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  51.43 
 
 
396 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.13 
 
 
390 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.43 
 
 
396 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  49.49 
 
 
399 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.49 
 
 
396 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  52.55 
 
 
388 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  50.26 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  51.45 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  52.63 
 
 
402 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  50 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.88 
 
 
402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.49 
 
 
396 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  47.4 
 
 
415 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.49 
 
 
415 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 
415 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.21 
 
 
397 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  51.27 
 
 
390 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  51.88 
 
 
384 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  48.82 
 
 
396 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.19 
 
 
397 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  49.36 
 
 
388 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.65 
 
 
379 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  49.87 
 
 
399 aa  348  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.51 
 
 
390 aa  348  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  46.53 
 
 
387 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.92 
 
 
398 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  49.49 
 
 
389 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.6 
 
 
397 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.16 
 
 
395 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  48.42 
 
 
395 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  48.44 
 
 
404 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.34 
 
 
394 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  51.23 
 
 
396 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.11 
 
 
390 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  48.2 
 
 
385 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.38 
 
 
403 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  49.19 
 
 
386 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  50 
 
 
393 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 
394 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  52.66 
 
 
385 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.53 
 
 
388 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  48.59 
 
 
390 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.63 
 
 
395 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.63 
 
 
395 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  46.53 
 
 
388 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  48.13 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  48.33 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  48.21 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  47.63 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.44 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  48.11 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.82 
 
 
394 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.21 
 
 
387 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.01 
 
 
387 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.61 
 
 
385 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.18 
 
 
408 aa  342  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.82 
 
 
394 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.67 
 
 
398 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  50.66 
 
 
390 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  52.42 
 
 
388 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.23 
 
 
396 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  48.97 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.56 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>