More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3166 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  73.25 
 
 		 533 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  66.73 
 
 		 512 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  100 
 
 		 508 aa  1026    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  73 
 
 		 514 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  73.18 
 
 		 533 aa  731    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  66.73 
 
 		 512 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  66.6 
 
 		 512 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  75.4 
 
 		 511 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  68.27 
 
 		 519 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  72.54 
 
 		 504 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  69.94 
 
 		 524 aa  691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  72.78 
 
 		 533 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  69.64 
 
 		 527 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  67.61 
 
 		 509 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  66.53 
 
 		 512 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  62.8 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  62.6 
 
 		 504 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  62.57 
 
 		 524 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  62.43 
 
 		 537 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  61.75 
 
 		 508 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  57.4 
 
 		 533 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  57.43 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  57.2 
 
 		 539 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  57.4 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  54.65 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  54.64 
 
 		 511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  53.65 
 
 		 517 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.65 
 
 		 523 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  52.86 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  49 
 
 		 517 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 523 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  52.79 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  50.6 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  49.6 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  49.01 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 520 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  52.49 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  46.93 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  50.3 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  51.69 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  50.4 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  47.39 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  47.23 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  49.7 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  48.59 
 
 		 546 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  50.2 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  47.28 
 
 		 522 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  47.31 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.68 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  46.29 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  45.96 
 
 		 539 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  45.6 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  45.8 
 
 		 534 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  46.68 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.88 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.21 
 
 		 514 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.45 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.78 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.45 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  40.12 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.96 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.89 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.88 
 
 		 503 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.77 
 
 		 511 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 511 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.84 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39 
 
 		 507 aa  356  5e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.57 
 
 		 514 aa  356  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  42.66 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40.9 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.62 
 
 		 527 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.25 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  39.11 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  41.75 
 
 		 503 aa  349  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  41.45 
 
 		 548 aa  349  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.86 
 
 		 525 aa  349  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  40.8 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.62 
 
 		 534 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 506 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.44 
 
 		 521 aa  342  8e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.88 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.47 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  41.27 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.47 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.47 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>