More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1894 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  51.37 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 407 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 398 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 398 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  36.34 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  40.11 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  30.38 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  33.96 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  30.4 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  35.12 
 
 		 526 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  33.05 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  35.12 
 
 		 537 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  32.83 
 
 		 433 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  31.02 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 425 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  32.16 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  31.2 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2537  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128789  normal  0.128017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>