267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0127 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0127  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 294 aa  613  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0271  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1883  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1720  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2159  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0896  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1182  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0363  allophanate hydrolase, subunit 1  70.83 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0008  allophanate hydrolase subunit 1  68.6 
 
 		 303 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6283  allophanate hydrolase subunit 1  70.59 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0366  allophanate hydrolase subunit 1  70.14 
 
 		 291 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4580  allophanate hydrolase subunit 1  68.17 
 
 		 311 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.632087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2954  allophanate hydrolase subunit 1  70.14 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.975999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2921  allophanate hydrolase subunit 1  67.7 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2771  allophanate hydrolase subunit 1  67.7 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2861  allophanate hydrolase subunit 1  67.01 
 
 		 295 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107171  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2438  allophanate hydrolase subunit 1  69.47 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2119  allophanate hydrolase subunit 1  68.99 
 
 		 295 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00766127  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2935  hypothetical protein  66.55 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0598  hypothetical protein  66.43 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06460  hypothetical protein  66.43 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000360881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2721  hypothetical protein  66.21 
 
 		 290 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.919225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5869  Allophanate hydrolase subunit 1  64.58 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3256  allophanate hydrolase subunit 1  63.86 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350388  normal  0.431322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2478  Allophanate hydrolase subunit 1  61.43 
 
 		 294 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2382  Allophanate hydrolase subunit 1  61.46 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4043  Allophanate hydrolase subunit 1  50.34 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1574  Urea carboxylase  28.37 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  27.44 
 
 		 1205 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  28.11 
 
 		 1183 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  26.52 
 
 		 1183 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  30.33 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  28.37 
 
 		 1182 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  25.68 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  25.44 
 
 		 1180 aa  99  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  27.46 
 
 		 1204 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  29.23 
 
 		 677 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  26.88 
 
 		 1212 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  28.52 
 
 		 1162 aa  95.9  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  26.12 
 
 		 1822 aa  96.3  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  26.18 
 
 		 1209 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  25.91 
 
 		 1176 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  25.48 
 
 		 242 aa  95.5  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  28.27 
 
 		 1197 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  26.55 
 
 		 1176 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  25.63 
 
 		 1204 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  24.83 
 
 		 1179 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  26.13 
 
 		 1243 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  25.97 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  25.35 
 
 		 1206 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  25 
 
 		 1208 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  25.17 
 
 		 1179 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  25.35 
 
 		 1204 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  25.54 
 
 		 1200 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  26.55 
 
 		 1205 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  26.33 
 
 		 1212 aa  89.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  24 
 
 		 1231 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  25.46 
 
 		 1172 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  26.15 
 
 		 1203 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  26.09 
 
 		 1200 aa  89  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  25.29 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  26.55 
 
 		 1205 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  26.55 
 
 		 1205 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  26.55 
 
 		 1207 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  25.42 
 
 		 1234 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  27.95 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  26.14 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  25 
 
 		 1205 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  25.35 
 
 		 1205 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  25 
 
 		 1205 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  25 
 
 		 1205 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  25.72 
 
 		 1179 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  26.91 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  24 
 
 		 1208 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  24.46 
 
 		 1201 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  28.43 
 
 		 1209 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  24.18 
 
 		 1226 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  25.27 
 
 		 1197 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  24.18 
 
 		 1488 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  24.13 
 
 		 1210 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  26.4 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  27.87 
 
 		 1228 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  28.63 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  24.11 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  25.09 
 
 		 1201 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  24.03 
 
 		 1233 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  27.75 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  25.39 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  23.67 
 
 		 1203 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  27.08 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  25 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  26.69 
 
 		 1238 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  28.57 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  24.31 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  25.17 
 
 		 1204 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>