74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4541 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  41.35 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 248 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 257 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>