More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2875 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2875  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3076  hypothetical protein  80.9 
 
 		 323 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  58.53 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  60.74 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  57.67 
 
 		 320 aa  348  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.2 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.03 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.27 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.33 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.93 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.4 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  42.42 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  39.87 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  39.87 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.39 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.23 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.23 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.21 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  39.27 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  36.16 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.71 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.54 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.22 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.15 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  38.71 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.17 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.93 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.19 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.62 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.02 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.29 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 322 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.1 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.22 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.11 
 
 		 322 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  40.89 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.74 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.74 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  37.21 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.42 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  36.79 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.25 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.51 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  37.95 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.66 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.01 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.55 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.41 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.57 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.87 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.14 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.59 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.9 
 
 		 328 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.33 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.58 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.31 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.11 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.54 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.06 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  37.09 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  38.26 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.76 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  37.92 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  36.62 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  36.91 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.05 
 
 		 322 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.23 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.8 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  37.66 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  37.34 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  36.04 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.22 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.7 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.77 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>