More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1598 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  83.94 
 
 		 330 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  44.41 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  43.96 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  39.87 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  43.1 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.48 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.62 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.69 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.62 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.01 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.84 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.45 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.15 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.1 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.22 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.83 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.7 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4556  hypothetical protein  38.8 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.912833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.34 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.82 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.35 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.63 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  36.79 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.05 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  38.78 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  36.39 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  37.25 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.05 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  36.47 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  37.46 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  34.6 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  35.09 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  34.97 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.5 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.88 
 
 		 335 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  34.14 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.84 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  37.03 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  35.76 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  36.42 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.38 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.28 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  37.25 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  38.44 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  34.25 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  34.6 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.47 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.78 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  32.23 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  33.83 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  36.63 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  37.03 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.39 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.54 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  34.59 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.44 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.92 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.27 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  37.84 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.62 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.63 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  34.8 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.67 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.83 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  33.55 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.17 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  34.23 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  35.88 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.75 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.31 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  35.62 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.45 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  33.95 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  38.92 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.33 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  34.95 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>