More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3044 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 813 aa  1624    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3771  Hpt sensor hybrid histidine kinase  97.36 
 
 		 455 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 		 811 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 923 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.24 
 
 		 882 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 781 aa  271  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  38.72 
 
 		 2109 aa  270  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 827 aa  267  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1059 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  39.1 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 947 aa  264  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 877 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 873 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 750 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 940 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.78 
 
 		 1193 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 866 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  38.57 
 
 		 770 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1195 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 934 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  34.39 
 
 		 987 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40 
 
 		 606 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  34.86 
 
 		 985 aa  255  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 645 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 944 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  34.45 
 
 		 984 aa  254  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 969 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.27 
 
 		 789 aa  253  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 717 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1075 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.15 
 
 		 772 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 606 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1127 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 932 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 863 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 738 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.7 
 
 		 778 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.7 
 
 		 778 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 767 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 855 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 718 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 750 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  39.12 
 
 		 651 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.86 
 
 		 778 aa  251  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.5 
 
 		 778 aa  250  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.86 
 
 		 778 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.86 
 
 		 778 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.86 
 
 		 778 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  33.2 
 
 		 785 aa  250  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.33 
 
 		 785 aa  250  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.86 
 
 		 778 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  34.23 
 
 		 784 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1068 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1229 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1199 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 855 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 984 aa  248  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 737 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 882 aa  247  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 846 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 969 aa  246  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 898 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1350 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.69 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 995 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1070 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 667 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.8 
 
 		 1060 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 902 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1771 aa  245  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 772 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  38.04 
 
 		 641 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.37 
 
 		 779 aa  244  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 		 785 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 695 aa  244  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 765 aa  244  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 633 aa  243  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 1363 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1110 aa  243  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1433 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.5 
 
 		 778 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 631 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 827 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 907 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  32.86 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.87 
 
 		 789 aa  243  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.04 
 
 		 777 aa  242  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  33.19 
 
 		 736 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  33.59 
 
 		 958 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.5 
 
 		 778 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1767 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1767 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.6 
 
 		 651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>