95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03012 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  79.04 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  79.04 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  51.26 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  51.38 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.23 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.69 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  38.27 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  34.85 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  37.15 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  36.79 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  41.27 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  35.91 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  37.19 
 
 		 318 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  32.39 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  43.18 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  39.87 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  37.3 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.5 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  37.69 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  37.23 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  37.23 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  37.31 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  34.7 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  38.48 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  26.99 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  35.51 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  35.51 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  33.75 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  36.81 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  38.24 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  34.02 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  31.88 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  35.26 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.05 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.33 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.33 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  30.86 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.6 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  31.98 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.81 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  29.25 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  24.02 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.04 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.63 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.53 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27.96 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  29.27 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  29.03 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  26.95 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.56 
 
 		 943 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.27 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  28.96 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.11 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  26.59 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  26.59 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  26.06 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  26.06 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  26.06 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.24 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.67 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.37 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.64 
 
 		 426 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.01 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  19.59 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.44 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.21 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  34.36 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30.53 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  27.34 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.71 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.97 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.02 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 552 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.51 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.74 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  30.61 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.23 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  26.91 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  21.71 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  27.6 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 491 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  35.11 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  35.11 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  35.11 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  33.66 
 
 		 428 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>