More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1031 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1031  CoA-binding  100 
 
 		 699 aa  1378    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  33.39 
 
 		 704 aa  220  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  30.86 
 
 		 698 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.19 
 
 		 929 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.69 
 
 		 911 aa  203  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  30.39 
 
 		 700 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.85 
 
 		 697 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 700 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  27.95 
 
 		 699 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  29.96 
 
 		 750 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.87 
 
 		 696 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  25.77 
 
 		 921 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 703 aa  187  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  30.2 
 
 		 711 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  27.86 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  31.18 
 
 		 712 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  28.79 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.01 
 
 		 698 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  28.79 
 
 		 680 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  27.21 
 
 		 912 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  28.91 
 
 		 700 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  26.68 
 
 		 918 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  26.76 
 
 		 920 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 698 aa  178  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  30.49 
 
 		 695 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 701 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 699 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 893 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  30.01 
 
 		 715 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 695 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 		 690 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  28.49 
 
 		 692 aa  171  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  30.21 
 
 		 715 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  27.5 
 
 		 895 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  26.43 
 
 		 915 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 883 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  28.59 
 
 		 708 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  24.97 
 
 		 905 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 		 926 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  28.94 
 
 		 697 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  28.65 
 
 		 883 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  27.3 
 
 		 913 aa  164  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  29.37 
 
 		 699 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  29.23 
 
 		 741 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 702 aa  163  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 702 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 		 898 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.28 
 
 		 892 aa  162  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  29.17 
 
 		 710 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  27.46 
 
 		 709 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  36.01 
 
 		 690 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 704 aa  160  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.67 
 
 		 699 aa  160  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  28.89 
 
 		 897 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  28.38 
 
 		 903 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  29.19 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  28.83 
 
 		 702 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.55 
 
 		 892 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 703 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 900 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.17 
 
 		 714 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 703 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  27 
 
 		 905 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 702 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  23.97 
 
 		 706 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  26.38 
 
 		 903 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  33.51 
 
 		 725 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  26.38 
 
 		 901 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 712 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 913 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 698 aa  152  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  28.55 
 
 		 693 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  24.5 
 
 		 711 aa  151  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  26.54 
 
 		 904 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  27.13 
 
 		 911 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  26.38 
 
 		 901 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 		 907 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 913 aa  151  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  27.51 
 
 		 899 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 		 889 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 893 aa  150  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 901 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  25.34 
 
 		 904 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 		 907 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 722 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  27.59 
 
 		 911 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  25.8 
 
 		 900 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 896 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  27.97 
 
 		 715 aa  147  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  27.12 
 
 		 695 aa  147  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  30.36 
 
 		 722 aa  147  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  24.39 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  28.57 
 
 		 705 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>