More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8714 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  65.73 
 
 
719 aa  953    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  89.47 
 
 
722 aa  1309    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  80 
 
 
709 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  80.91 
 
 
713 aa  1178    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  100 
 
 
722 aa  1459    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  35.81 
 
 
680 aa  425  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  35.8 
 
 
688 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
707 aa  422  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  37.28 
 
 
689 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  34.68 
 
 
680 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  35.14 
 
 
687 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  34.82 
 
 
694 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  34.48 
 
 
687 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  33.81 
 
 
707 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  35.74 
 
 
676 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
705 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  42.63 
 
 
704 aa  351  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
753 aa  348  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  40.7 
 
 
696 aa  334  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40.04 
 
 
714 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.66 
 
 
711 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  37.28 
 
 
706 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  39.73 
 
 
698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 
703 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  38.75 
 
 
702 aa  313  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  40.22 
 
 
698 aa  313  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  38.75 
 
 
702 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  40.64 
 
 
696 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  38.8 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.33 
 
 
697 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.67 
 
 
699 aa  302  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.61 
 
 
929 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  34.79 
 
 
698 aa  287  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  37.53 
 
 
700 aa  286  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 
701 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  35.09 
 
 
892 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.38 
 
 
918 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.57 
 
 
706 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  36.17 
 
 
915 aa  279  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  35.78 
 
 
911 aa  277  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.84 
 
 
712 aa  274  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  28.18 
 
 
710 aa  273  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  33.84 
 
 
464 aa  272  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  36.05 
 
 
920 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  35.78 
 
 
477 aa  269  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  35.16 
 
 
912 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.09 
 
 
905 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
472 aa  267  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  35.85 
 
 
883 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.87 
 
 
892 aa  264  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.48 
 
 
699 aa  264  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  34.7 
 
 
921 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.95 
 
 
660 aa  261  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  28.87 
 
 
705 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  34.7 
 
 
461 aa  261  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
711 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  34.33 
 
 
709 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 
508 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.75 
 
 
897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  35.24 
 
 
698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
660 aa  252  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  34.56 
 
 
699 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  31.9 
 
 
705 aa  250  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
889 aa  249  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  35.98 
 
 
516 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  35.19 
 
 
461 aa  248  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.78 
 
 
900 aa  246  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
907 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  35.25 
 
 
704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.25 
 
 
895 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 
893 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.28 
 
 
707 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
461 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.44 
 
 
695 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.53 
 
 
913 aa  237  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.22 
 
 
697 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
907 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
907 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.41 
 
 
911 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  38.32 
 
 
904 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.15 
 
 
903 aa  231  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  36.69 
 
 
451 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
728 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  36.86 
 
 
887 aa  228  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  31.73 
 
 
703 aa  227  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  31.42 
 
 
697 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.09 
 
 
693 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
899 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  32.35 
 
 
886 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
451 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34 
 
 
727 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  30.12 
 
 
711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.65 
 
 
700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
897 aa  218  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
926 aa  218  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  32.24 
 
 
375 aa  218  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.83 
 
 
750 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.85 
 
 
881 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.41 
 
 
900 aa  217  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  30.3 
 
 
893 aa  213  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>