More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4996 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 705 aa  1404    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 707 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 680 aa  298  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  32.9 
 
 		 688 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 687 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  32.27 
 
 		 707 aa  287  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  32.4 
 
 		 687 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 705 aa  279  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  31.42 
 
 		 680 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 		 694 aa  277  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  33.61 
 
 		 713 aa  277  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  34.01 
 
 		 753 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 689 aa  262  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 		 722 aa  259  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  32.21 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  32.36 
 
 		 722 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  33.72 
 
 		 676 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  32.09 
 
 		 719 aa  247  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  33.28 
 
 		 711 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.91 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  37.85 
 
 		 883 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 669 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.5 
 
 		 698 aa  221  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  36.77 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  36.41 
 
 		 696 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.24 
 
 		 711 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 706 aa  213  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  30.03 
 
 		 710 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 702 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 703 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  37.85 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 702 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  34.2 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 701 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  33.83 
 
 		 700 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.04 
 
 		 920 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 918 aa  203  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.04 
 
 		 699 aa  203  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  31.99 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 711 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.97 
 
 		 911 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.01 
 
 		 921 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  27.02 
 
 		 705 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.96 
 
 		 929 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.76 
 
 		 712 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  35.37 
 
 		 698 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.53 
 
 		 714 aa  197  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  35.49 
 
 		 700 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  32.76 
 
 		 697 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 		 695 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  32.83 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 		 750 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  28.54 
 
 		 707 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 703 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 718 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  31.28 
 
 		 699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 893 aa  185  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 477 aa  185  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  32.69 
 
 		 915 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 492 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 727 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  29.24 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 712 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 451 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.34 
 
 		 728 aa  180  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  36.47 
 
 		 821 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.26 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  32 
 
 		 892 aa  178  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  33.14 
 
 		 976 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  27.1 
 
 		 464 aa  178  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 718 aa  177  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  31.57 
 
 		 698 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.9 
 
 		 892 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 889 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.61 
 
 		 895 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  30.98 
 
 		 637 aa  174  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  32.62 
 
 		 907 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.84 
 
 		 913 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.09 
 
 		 905 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  34.97 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.93 
 
 		 912 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 898 aa  171  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 		 893 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  32.3 
 
 		 903 aa  170  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 698 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  33.01 
 
 		 899 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.42 
 
 		 900 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  32.11 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 893 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  28.18 
 
 		 911 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 911 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 898 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.43 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 508 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.47 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 		 903 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.14 
 
 		 708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>