More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3442 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  100 
 
 
710 aa  1444    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  62.64 
 
 
705 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  32.47 
 
 
687 aa  323  8e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
680 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  31.28 
 
 
680 aa  312  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
707 aa  310  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  30.47 
 
 
688 aa  303  9e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  32.6 
 
 
689 aa  299  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  28.23 
 
 
705 aa  290  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  32.2 
 
 
687 aa  286  9e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  30.21 
 
 
707 aa  279  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  28.75 
 
 
709 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  31.79 
 
 
719 aa  270  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  30 
 
 
676 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  28.33 
 
 
722 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  27.29 
 
 
713 aa  267  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 
694 aa  266  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  27.97 
 
 
722 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  28.88 
 
 
753 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  35.26 
 
 
706 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
702 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  32.92 
 
 
702 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
703 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  33.26 
 
 
461 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  31.24 
 
 
472 aa  223  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.8 
 
 
929 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  31.3 
 
 
461 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0290  CoA-binding domain-containing protein  31.88 
 
 
461 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.388357  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.36 
 
 
911 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  30.12 
 
 
705 aa  207  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.72 
 
 
697 aa  207  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
696 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 
477 aa  205  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  29.57 
 
 
461 aa  206  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.48 
 
 
696 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
918 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.02 
 
 
921 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.35 
 
 
707 aa  199  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.08 
 
 
706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  29.91 
 
 
711 aa  198  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  29.72 
 
 
714 aa  197  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.79 
 
 
912 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  29.98 
 
 
464 aa  197  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.16 
 
 
699 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  29.04 
 
 
915 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  29.75 
 
 
711 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
701 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.44 
 
 
660 aa  193  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.89 
 
 
698 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.02 
 
 
920 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.06 
 
 
897 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.33 
 
 
895 aa  190  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  29.78 
 
 
451 aa  190  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.98 
 
 
728 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  30.87 
 
 
451 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.89 
 
 
700 aa  187  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  29.57 
 
 
508 aa  187  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  29.93 
 
 
911 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
898 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.45 
 
 
892 aa  185  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.38 
 
 
660 aa  183  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.5 
 
 
699 aa  183  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  28.04 
 
 
697 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.84 
 
 
711 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  30.22 
 
 
492 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.59 
 
 
883 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
889 aa  180  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.42 
 
 
896 aa  180  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  31.47 
 
 
375 aa  179  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  30.73 
 
 
699 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  28.64 
 
 
913 aa  178  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 
709 aa  178  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  30.3 
 
 
700 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
896 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  27.78 
 
 
695 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  29.68 
 
 
900 aa  177  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
516 aa  177  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.48 
 
 
905 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  30.67 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
893 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  30.05 
 
 
692 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  30.61 
 
 
698 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 
711 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
710 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
893 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  29.68 
 
 
901 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 
901 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 
901 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 
905 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
704 aa  171  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0977  CoA-binding domain-containing protein  29.42 
 
 
484 aa  171  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000724597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  28.01 
 
 
699 aa  170  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  29.9 
 
 
900 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
913 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  29.93 
 
 
899 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.27 
 
 
711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  27.69 
 
 
750 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  31.49 
 
 
708 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 
904 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  28.97 
 
 
904 aa  168  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>